MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 2

Total Repeats: 2691

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011988	CGA	2	6	224867	224872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_011988	ATT	2	6	224888	224893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_011988	ATTC	2	8	224966	224973	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
504	NC_011988	TCC	2	6	225011	225016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
505	NC_011988	TGC	2	6	225215	225220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_011988	TG	3	6	225222	225227	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
507	NC_011988	CCAA	2	8	225250	225257	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
508	NC_011988	TCA	3	9	225271	225279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_011988	ATG	2	6	225354	225359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_011988	AG	3	6	228010	228015	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
511	NC_011988	TTA	2	6	228052	228057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_011988	AGG	2	6	228095	228100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
513	NC_011988	ATCT	2	8	228154	228161	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
514	NC_011988	GTC	2	6	228186	228191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_011988	ACA	2	6	228248	228253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_011988	GGA	2	6	228260	228265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
517	NC_011988	GGA	2	6	228330	228335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
518	NC_011988	GCA	2	6	228365	228370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_011988	G	6	6	228398	228403	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
520	NC_011988	T	6	6	229488	229493	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_011988	TAT	2	6	229498	229503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_011988	TGCA	2	8	229553	229560	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
523	NC_011988	TGG	2	6	233996	234001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
524	NC_011988	TGC	2	6	234023	234028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_011988	T	6	6	234083	234088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_011988	TTC	2	6	234131	234136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_011988	AAGCCG	2	12	235233	235244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_011988	CAC	2	6	236105	236110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
529	NC_011988	CCA	2	6	236127	236132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
530	NC_011988	GTT	2	6	236837	236842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_011988	TGA	2	6	236844	236849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_011988	TCC	2	6	236885	236890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
533	NC_011988	TCA	2	6	239765	239770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_011988	T	7	7	241485	241491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_011988	GCT	2	6	241525	241530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_011988	AAT	2	6	244643	244648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_011988	TTAA	2	8	245954	245961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_011988	CTG	2	6	247372	247377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_011988	GCC	2	6	247381	247386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
540	NC_011988	GGC	2	6	247400	247405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_011988	CGG	2	6	251305	251310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_011988	TGG	2	6	251319	251324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
543	NC_011988	AGG	2	6	251325	251330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
544	NC_011988	GACC	2	8	252865	252872	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
545	NC_011988	CTG	2	6	253257	253262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_011988	AT	3	6	253420	253425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_011988	TCC	2	6	254438	254443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
548	NC_011988	T	6	6	254539	254544	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_011988	ATG	2	6	254579	254584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_011988	CCTG	2	8	254585	254592	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
551	NC_011988	GAAA	2	8	254643	254650	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
552	NC_011988	AAT	2	6	254708	254713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_011988	TGG	2	6	254735	254740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
554	NC_011988	TCGG	2	8	254767	254774	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
555	NC_011988	CGAT	2	8	254785	254792	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
556	NC_011988	AGA	2	6	254823	254828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_011988	CT	3	6	260537	260542	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
558	NC_011988	AG	3	6	260598	260603	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
559	NC_011988	TGGC	2	8	260612	260619	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
560	NC_011988	AGAC	2	8	260691	260698	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
561	NC_011988	CT	3	6	260705	260710	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
562	NC_011988	ATT	2	6	260824	260829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_011988	TTC	2	6	260839	260844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_011988	GAG	2	6	260870	260875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
565	NC_011988	CGC	2	6	262924	262929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
566	NC_011988	ATG	2	6	270157	270162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_011988	ATCA	2	8	270166	270173	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
568	NC_011988	CG	3	6	270238	270243	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
569	NC_011988	CGAG	2	8	270282	270289	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
570	NC_011988	GTC	2	6	270329	270334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_011988	CGT	2	6	270390	270395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_011988	CTTC	2	8	270396	270403	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
573	NC_011988	TGA	2	6	270408	270413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
574	NC_011988	CGG	2	6	270476	270481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_011988	ATT	2	6	270490	270495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_011988	A	8	8	270643	270650	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_011988	TCA	2	6	276588	276593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_011988	CT	3	6	276641	276646	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
579	NC_011988	GCG	2	6	276690	276695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_011988	TTG	2	6	286694	286699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_011988	TTTG	2	8	286767	286774	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
582	NC_011988	TGA	2	6	287819	287824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_011988	ACAAA	2	10	292158	292167	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
584	NC_011988	ACG	2	6	292172	292177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_011988	GCT	2	6	293741	293746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_011988	GCG	2	6	297283	297288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_011988	CAA	2	6	297335	297340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_011988	TTGGC	2	10	299012	299021	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
589	NC_011988	CTGG	2	8	299107	299114	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
590	NC_011988	A	7	7	299169	299175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_011988	GCG	2	6	299345	299350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_011988	ACAA	2	8	299880	299887	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
593	NC_011988	GAG	2	6	299901	299906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
594	NC_011988	CCA	2	6	301359	301364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
595	NC_011988	AG	3	6	301399	301404	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
596	NC_011988	ACC	2	6	301426	301431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
597	NC_011988	A	6	6	301434	301439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_011988	AATCGG	2	12	303144	303155	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
599	NC_011988	CAA	2	6	303174	303179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_011988	AT	3	6	303211	303216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_011988	GCCT	2	8	303289	303296	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
602	NC_011988	T	7	7	305181	305187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_011988	CTT	2	6	305264	305269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_011988	T	6	6	305268	305273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_011988	TAAA	2	8	305288	305295	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_011988	GA	3	6	307265	307270	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
607	NC_011988	CTA	2	6	310165	310170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_011988	GCTTT	2	10	310203	310212	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
609	NC_011988	CTT	2	6	310788	310793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_011988	GGA	2	6	310898	310903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
611	NC_011988	GCC	2	6	311488	311493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
612	NC_011988	ACA	2	6	311547	311552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_011988	CGC	2	6	311584	311589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
614	NC_011988	ATGG	2	8	311631	311638	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
615	NC_011988	GGC	2	6	313023	313028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_011988	AGG	2	6	313047	313052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
617	NC_011988	T	6	6	313054	313059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_011988	CGG	2	6	315807	315812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_011988	GCAG	2	8	316294	316301	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
620	NC_011988	ACC	2	6	316319	316324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
621	NC_011988	TCA	2	6	316327	316332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_011988	T	6	6	317847	317852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_011988	TCG	2	6	317999	318004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_011988	CTGG	3	12	318036	318047	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
625	NC_011988	CTT	2	6	319941	319946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_011988	GAG	2	6	319986	319991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
627	NC_011988	T	6	6	322465	322470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_011988	AGTG	2	8	324852	324859	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
629	NC_011988	A	6	6	325241	325246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_011988	CAT	2	6	325324	325329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_011988	CAT	2	6	325364	325369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_011988	GA	3	6	325409	325414	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
633	NC_011988	TGT	2	6	325516	325521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
634	NC_011988	CCT	2	6	325522	325527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
635	NC_011988	GTGC	2	8	325542	325549	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
636	NC_011988	TC	3	6	327918	327923	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
637	NC_011988	TTG	2	6	327931	327936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
638	NC_011988	CT	4	8	328057	328064	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
639	NC_011988	GGC	2	6	329720	329725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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